Originally Posted by
it-ogo С молоком ситуация другая. Гласные редуцируются одинаково, но о и а в других ситуациях вполне различимы и ни одну из них упразднить нельзя. Что из них писать конкретно в "малаке" по большому счету неважно, главное чтобы был стандарт, так что реформировать его смысла нет. А ять была фонетически эквивалентна Е во всех ситуациях. Думаю, что в принятии решения об изъЯТии яти было существенно именно это, а не история происхождения.
Хотя большевики потом, конечно, вели агиткампанию за новую орфографию в духе "мы - молодость мира, а они - старые п...ны," но это было уже вторично.
Что же касается фонетических различий Е и яти именно в церковнославянском, я сильно сомневаюсь, что это различие сохранялось в речи попов, даже тех, что свободно могли изъясняться на ЦС. Изначальное произношение - то, что исчезает в мертвых языках первую очередь.