Если события описываются в ретроспективе, то да, "в тот момент он был уверен (past), что через год окончит университет".

Но фактически действие могло не произойти. Например, описывается биография человека, который по состоянию на 1940 г. учился в университете, на предпоследнем курсе. Про него мы можем написать: "Через год заканчивал университет" (в 1941). Далее: "но началась война, и он пошёл добровольцем на фронт" (университет бросил).