The verb называть allows both using the name in instrumental and citing the name as is (in nominative).

их называли женским батальоном = их называли «женский батальон»
Сердюкова называли командиром женского батальона = Сердюкова называли «командир женского батальона»

In this sentence, they chose different forms for some reason, but it would also be OK if there were two instrumentals or two nominatives.