1.

Что такое... = What is... (about inanimate things)
Кто такой/кто такая/кто такие... = Who/What is... (about persons)

Examples from Google:
Что такое Skype?
Что такое Холокост?
Что такое любовь.
Что такое эсперанто?
Что такое дежавю?
Что такое виджеты?
Кто такие гопники и как себя с ними вести.
Кто такой хипстер?
Кто такой Иисус Христос?

Questions like Что Skype? Что Холокост? Что любовь? Что эсперанто? make no sense to me, you have to add такое to indicate that that is a "what" + "is" question.

With pronouns, different word order is typically used:
Кто я такой?
Кто мы такие?
Кто ты такой?
Кто вы такие?
Кто он такой?
Кто она такая?
Что это такое?

Sentences without такое/такой/такая are possible with these pronouns (and ONLY with them) :
Кто я?
Кто мы?
Кто ты?
Кто вы?
Кто он?
Кто она?
Что это?

The meaning is almost the same. With такое/такой/такая, it is more like "what kind of...", "what sort of...".
"Кто ты такой?" - "What kind of man are you?"
"Кто ты?" - "Who are you?"

Quote Originally Posted by xXHoax View Post
"Ааа, ты знаешь что такое" vs "знаешь что это."
The first does not look like a complete sentence. Probably it should be "Ааа, ты знаешь, что это такое?" or "Ааа, ты знаешь, что такое X?" with X = any noun.