Ну, тут есть две школы мысли

Некоторые закоренелые линуксоиды считают (и правильно, считают, на мой взгляд), что произностить это слово нужно так, как ег произносит его создатель. Аудиофайлы с записью голоса Линуса Турвалдса можно найти во многих дистрибутивах Линукса или в сети, например, здесь: http://www.paul.sladen.org/pronunciation

Но большинству англоязычных юзеров на эти тонкости глубоко плевать, и они произносят, как бог на душу положит -- чаще всего именно "лайнэкс"