Во-первых, фраза "это был моим выбором" не верна грамматически.
Лучше задать вопрос следующим образом:
1. Это был мой выбор;
2. Это было моим выбором.
Чем они отличаются?


А что касается того, чем они относительно друг друга отличаются, то тут всё просто - практически ничем. Хотя в разговоре чаще употребляется первый вариант.
These phrases have no differences in their meanings. However, the 1-st option is used more frequently.