"То ли..., то ли..." - это составной союз, обозначающий то же самое что "или..., или..." и "либо..., либо...".

"И непонятно, то ли жизнь всегда была бессмысленной, а ты просто не замечал этого, то ли смысл был, но куда-то затерялся." = "И непонятно, либо жизнь всегда была бессмысленной, а ты просто не замечал этого, либо смысл был, но куда-то затерялся." = "И непонятно, или жизнь всегда была бессмысленной, а ты просто не замечал этого, или смысл был, но куда-то затерялся."